新竹前市長林智堅論文案,除了2008年中華大學碩士論文遭疑抄襲竹科研究案,2016年的台大國發所碩論也受質疑。7月6日已經有台大學生向學校檢舉;台大國發所7日晚間也發出聲明,台大將在2個月內做出審查結果。國民黨團17日上午再開記者會提出相關資料,質疑除了林智堅、余正煌論文相似度極高,同時也疑似抄襲指導教授、現任國安局長陳明通和研究助理楊喜慧在2014年的一份研究報告,到底是誰抄誰?還是陳明通拿自己的研究報告給林智堅「參考」,演變成整本剽竊成論文?藍委表示,國人等陳明通、林智堅、余正煌出面說清楚。