新冠肺炎（武漢肺炎）疫情持續升溫，機場出入境旅客量大幅減少，連帶影響桃園機場捷運的營運。桃捷公司指出，通車3年以來，運量50%來自出入境旅客，且機場出入境旅客約每3人就有1人搭乘機場捷運，讓桃園機場捷運成為桃園機場聯外重要交通工具，但受疫情影響，今年4月機場捷運日平均運量比起去年下滑58%。
桃捷公司說明，機場航廈站（A12、A13）兩站進出日平均運量較去（2019）年減少82%，其中A13機場第二航廈站日平均運量減少78%、A12機場第一航廈站減少86%，票箱收入比起去年同期短收高達1.75億元。
桃捷公司表示，已向交通部爭取將機場捷運比照桃園機場周邊相關產業，納入紓困補助範圍。此外，因今年3月營收比起去年同期減少59%，符合經濟部於4月10日發布今年3-9月營收減少50%服務業水電費減免方案，桃捷公司估計每月可減免約8百萬水電費，但此部分依經濟部新修正發布之紓困辦法，須由中央目的事業主管機關即交通部認定為受疫情影響事業，將極力爭取獲得認定，以減輕營運壓力。
桃捷公司除積極向交通部、經濟部申請紓困補助之外，也實施撙節措施，於4月6日至6月14日調整直達車離峰時間班距，總計減少直達車共3780趟次，希望在撙節成本和旅客服務中求取平衡，也盼行政院通過「第二階段擴大紓困振興方案」將機場捷運納入，紓解營運壓力，維持機場捷運運作。 （相關報導： 若疫情持續延燒、不排除封城 黃偉哲動怒：軍方連多少官兵去看病都講不清楚 ｜ 更多文章 ）
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